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Per poter capire la decontaminazione, e tutto il processo di sterilizzazione nell'autoclave, è importante prima parlare un po' del rischio, soprattutto del rischio biologico. Il rischio biologico consiste nella probabilità di subire una malattia causata da microrganismi. Questo rischio biologico però dipenderà dal microrganismo che esiste in quel momento particolare, dal numero di microrganismi presenti, dalla capacità di sopravvivere di essi e dalla capacità di difesa dell'organismo invaso, intenso come capacità di difesa dell'organismo all'ospite, che in questo caso sarebbe dov'è appena penetrato il microrganismo. Dentro del rischio biologico è importante conoscere la contaminazione. Cosa si intende per contaminazione, cosa si intende per infezione è anche cosa si intende per la malattia infettiva?